A l'époque où le monde n'était composé que de samouraï et que les guerres faisaient rage, un homme arriva sur terre, un moine, qui amena la paix et apprit l'art ninja autour de lui, il était le créateur du ninjutsu et possédait des pouvoir hors du commun. Un jour, il affronta un monstre nommé Juubi, il le scella et divisa sa puissance en neuf, ce qui eut pour effet de créer autant d'entité. Appelés les bijuus, ils possédaient chacun une puissance sans égal et ils vécurent auprès du Rikudou jusqu'à sa mort mais il laissa derrière lui des objets, sept artefacts ayant pour but de donner une puissance égale à celle d'un bijuu pour les arrêter, s'ils devenaient une trop grande menace. Le temps passa et les guerres avaient repris de façon beaucoup plus violente, les ninjas étaient répartis en clan, qui n'avaient que pour seuls buts la survie et la suprématie sur tous les autres. Parmi tous ceux là, deux clans sortirent du lot : le clan Uchiwa et Senju, deux clans descendant du Rikudou qui se livrèrent dans une guerre sanglante.

Au bout de plusieurs jours, Madara Uchiwa et Hashirama Senju les deux chefs des deux clans qui se battirent depuis plusieurs jours, décidèrent de collaborer, obligé de constater qu'aucun d'eux ne remporterait la victoire. Devenus alliés ils fondèrent le village caché des feuilles Konoha, cependant une alliance qui semblait avoir des bases solides, était plus fragile qu'il n'y parait. Le clan Senju gagnait plus d'influence dans le village jusqu'à en prendre le contrôle tandis que le clan Uchiwa était reclus et surveillé. Lorsqu'il le comprit Madara Uchiwa appela à la rébellion en vain, ses camarades étaient fatigués de faire la guerre. Le leader du clan décida alors de quitter Konoha promettant de se venger, s'entama alors un affrontement titanesque entre les deux anciens amis dans une plaine verdoyante. Ce combat s'acheva avec la victoire d'Hashirama laissant Madara pour mort, et la plaine verdoyante avait subit de grands changement topologique et est connu aujourd'hui comme la vallée de la fin.

100 ans se sont écoulés, le clan Uchiwa a été exterminé par Itachi Uchiwa sans que personne ne connaisse ses motivations. Un jeune ninja, Naruto Uzumaki est l'hôte de Kyuubi, sorti de l'académie et dû faire équipe avec le seul survivant du massacre de sa famille : Sasuke Uchiwa. Et avec une jeune fille ne le laissant pas indifférent : Sakura Haruno sous les ordres de Kakashi Hatake, le ninja copieur. Avec eux, il fit bon nombre de mission renforçant leurs liens de plus en plus mais Sasuke qui s'était promis de tuer son frère Itachi pour venger son clan, voyait Naruto gagner en puissance de façon exponentielle sans avoir l'impression de s'améliorer. C'est ainsi qu'il accepta l'offre d'Orochimaru l'un des Sannin de Konoha, de déserter le village pour suivre son enseignement en plongeant ainsi dans les ténèbres.

Afin d'arrêter son ami, Naruto partit à sa poursuite et livra un combat avec lui dans la vallée de la fin comme un coup du destin, les deux amis destinés à se battre, l'un pour sa liberté, l'autre pour le protéger. Ce combat passionnant auquel personne ne put assister, s'acheva par le départ de Sasuke de façon irréversible. Afin de devenir plus fort, Naruto décida de partir s'entrainer sous les ordres de Jiraya, l'ancien ami d'Orochimaru et également l'un des trois Sannins, qui avait déjà enseigné au jeune garçon la technique d'invocation et le rasengan.
Aujourd'hui trois ans se sont écoulés, Naruto rentre à Konoha avec Jiraya après avoir beaucoup muri et gagné en puissance. Il refit équipe avec Sakura et Kakashi avec qui, il sauva Gaara, le Jinchuuriki d'Ichibi, de l'Akatsuki,une organisation criminelle qui veut s'approprier la puissance des bijuus. Dans le même temps un homme venu d'on ne sait où débarque au pays du vent avec des sombres intentions. De son coté Sasuke qui a atteint une puissance des plus impressionnante s'est retourné contre son ancien maître alors qu'Orochimaru voulait s'approprier son corps, la technique s'est retourné contre son utilisateur et Sasuke a pris les pouvoirs de son sensei.

A ce moment cet homme inconnu répondant au surnom de Red Rose a créer une organisation : Seifuku, après avoir pris le contrôle du village de Kusa ayant pour objectif de contrôler les cinq villages et mettre la main sur les sept objets du Rikudou pour écraser ses ennemis.

C'est à présent à vous d'écrire la suite de cette histoire.